Я так объясню с чего с неё может быть вредного.
1) Излучение СВЧ (микроволновой) печи отличное от теплового. Ибо ведёт себя по другому. Поэтому оно по другому влияет и приобразует вещество. Это возможно что по другому.

2) На обработанном веществе остаётся вместо теплового излучения - другое микроволновое а не тепловое.